多管发酵法是根据大肠菌群能发酵乳糖产酸产气的特征，检测水样中大肠菌群的方法。多管发酵的大肠菌群阳性，如果在44.5℃的培养基上进行24h的培养，能释放出荧光产物而使培养基在紫外光源的照射下呈现荧光反应，此种方法即可检测出样本中是否含有大肠，具体步骤：取一定量水样于乳糖蛋白胨培养液中进行初发酵实验(推测实验)，再进行平板分离(证实实验)复负发酵实验鉴定(完成实验)。
根据各稀释度发酵的管数查可能数(mostprobablenumber，粪大肠检测系统，mpn)表，求得每10ml或每升水样中的大肠菌群数。该法方法简单，实验的要求和成本低，但是该方法易受其他因素的干扰而影响结果的准确性。
酶底物法检测工作原理酶底物法使用onpg和mug两种营养生长指示剂，其中onpg试剂在36℃的培养基中会被总大肠菌群产生的特---β-半乳糖苷酶分解代谢，使水样从无色变为黄色，粪大肠检测装置，在44.5℃的培养基中会被粪大肠菌群(耐热大肠菌群)产生的特---β-半乳糖苷酶分解代谢，使水样从无色变为黄色，mug试剂在36℃的培养基中会被大肠埃希氏菌产生的特---β-葡糖---酶分解代谢，使水样在紫外灯下发出荧光，从而实现水质大肠菌群的检测。
每批试剂需做验证检验：向一份100ml无菌水样中接种含有粪大肠菌的质控样标准菌株，按照上述定量检测步骤操作观察结果，看结果是否在其范围内。
9 注意事项
9.1 如果水样品有背景颜色，需做一个空白试验，与标准检测结果相比较。
9.2 只可使用灭菌水，不含缓冲液的水，江苏粪大肠检测，不含氧化剂的水进行样品稀释。
9.3 此法所用试剂只用于常规水样，不可用于浓缩水样。
9.4 如水样中含有过多的氯，则加入试剂可能显蓝光，粪大肠检测设备，则该水样不可用此方法。
9.5 此法无需在无菌室中进行，但操作过程因避免微生物污染。
9.6 检测使用过的定量盘应灭菌后弃去。把约30个定量盘放入防爆袋中，用绳子松松的扎住袋口，放入高压蒸汽灭菌锅中，121℃高压灭菌20min后取出，在防爆袋上注明“生物垃圾已灭菌”方可弃去。
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